Resmi Tamat, Berikut Nasib Para Karakter Alchemy of Souls 2 

Selama ini tubuh Jin Bu Yeon (Ko Yoon Jung) berisi oleh jiwa, yakni jiwa Jin Bu Yeon yang memiliki kekuatan Jin Seol Ran dan Naksu. Keduanya selalu bergantian bangun untuk mengembalikan kekuatan mereka masing-masing.

Jiwa Naksu kemudian menghilang karena Jin Bu Yeon berhasil mendapatkan kembali kekuatannya. Jin Bu Yeon lalu melakukan tugasnya untuk memusnahkan Hwajo lalu menyerahkannya ke Jang Uk untuk dimusnahkan. Setelah misinya berhasil, ia lalu menyerahkan tubuhnya ke Naksu dan jiwa Naksu kembali.

Raja Go Soon (Choi Kwang Il) bekerja sama dengan Jin Mu (Jo Jae Yun) dan para penyihir lain untuk membangunkan Hwajo dan mendapatkan kekuatan pemindah jiwa. Untuk itu, Jang Uk (Lee Jae Wook) menyerahkan plakat emas kepada Putra Mahkota Go Woon
(Shin Seung Ho) untuk menghentikan sang Raja. Dengan plakat emas dari Raja sebelumnya, Putra Mahkota secara resmi dapat membuat Raja turun tahta. Putra Mahkota lalu naik tahta dan menjadi Raja yang adil dan bijaksana.

Saat berusaha membangunkan Hwajo, Jang Uk datang dan mengambil alih. Sehingga Hwajo bangun dan memusnahkan Jin Mu dan penyihir lain yang ada di Pertemuan Umum. Mereka semua musnah dan hangus terbakar tanpa tersisa.

Setelah pernikahan Park Dang Gu (Yoo In Soo) dan Jin Cho Yeon (Arin) batal di Alchemy of Souls season pertama, cinta masih bersemi di hati masing-masing. Setelah semua misi berhasil dan dunia kembali damai, Park Dang Gu dan Jin Cho Yeon menikah. Mereka lalu dikaruniani bayi laki-laki kembar bernama Dan dan Gang dengan marga Park.

Jin Ho Gyeong (Park Eun Hye) penguasa Jinyowon, Park Jin (Yu Jun Sang) dan Kim Do Joo (Oh Na Ra) selamat dari malapetaka yang akibat ulah Jin Mu. Jin Ho Gyeong kembali ke Jinyowon. Sedangkan Park Jin dan Kim Do Joo menikah. Saat keduanya sedang menjaga Dan dan Gan, Kim Do Joo mual. Akhir dari hubungan mereka menandakan bahwa Kim Do Joo sedang hamil dan Park Jin merasa bahagia.

Jeongjingak yang selama di Alchemy of Souls 2 tutup dan ditinggal para murid penyihirnya, akhirnya dibuka kembali. Pemimpin dari Jeongjingak adalah Seo Yul (Minhyun) sekaligus menjadi kepala guru Jeongjingak. Rekrutmen terbuka terhadap penyihir yang ingin menjadi murid di Jeongjingak diadakan untuk mendapatkan kembali para penyihir yang berpotensi. Salah satunya adalah Sun I anak buah tabib Heo Yun Ok dan Yong Pil anak buah So I.

Guru Lee Cheol (Lim Chul Soo) akhirnya menjadi guru sekaligus orang kepercayaan Putra Mahkota yang telah naik tahta menjadi Raja. Sehingga muncul rumor bahwa Raja meminum teh daguen yang membuatnya tidak memiliki hasrat seksual. Rumor itu menyebar dan membuat Raja akan membuat ajang pemilihan pencarian Ratu untuk meneruskan keturunan. Dalam pemilihan itu, Raja akan dibantu Jin Bu Yeon atau Naksu untuk memilih calon Ratu yang memiliki energi yang baik.

Akibat ulah Jin Mu, gerbang artefak di Jeongjingak terbuka dan 31 artefak artefak berhasil kabur. Artefak-artefak itu bisa membayakan kehidupan manusia. Untuk itu, Jang Uk dan Jin Bu Yeon bekerja sama untuk memburu puluhan artefak tersebut dan baru 12 diantaranya yang berhasil ditangkap.

Keduanya kembali bersama menjadi suami istri, bekerja sama untuk mengembalikan kehidupan yang damai dengan kekuatan masing-masing. Oya, keduanya juga berencana memiliki anak kembar perempuan dan akan mewarisi marga Jin. Hal itu disampaikan oleh Park Dang Gu dan Jin Cho Yeon saat keduanya bertemu sang ibu. Bahwa kedua pasangan ini akan memiliki keturunan dengan berbagi marga Park dan Jin.

Akhirnya Alchemy of Souls berakhir tamat dengan happy ending tanpa menyisakan tanda tanya. Menjadi akhir yang memuaskan bagi para penggemar yang telah mengikuti serial ini dari season pertama.